中国人民解放军新疆军区成立于1949年12月，时为二级军区，隶属西北军区建制;1955年5月升格为大军区，直属中央军事委员会领导;1979年改称乌鲁木齐军区;1985年6月与兰州军区合并，同时成立新疆军区，为兵团级，隶属兰州军区领导;1992年4月因取消兵团级建制而改为正军级;1998年10月升格为副大军区级至今。
新疆军区司令员
彭德怀(49.11-51.04)
彭德怀(1898—1974)，原名得华，号石穿，湖南省湘潭县人，中华人民共和国十大元帅之一;彭德怀是德高望重的老一辈无产阶级革命家、军事家和政治家，是中国共产党、中华人民共和国与中国人民解放军的卓越领导人之一;他把毕生的精力献给了中国人民的解放事业和社会主义国防及建设事业，建立了不朽的历史功勋;他有着坚定的共产主义信念和坚强的党性原则，始终保持坦荡的革命胸怀，保持艰苦奋斗的作风;他极其关心人民群众的疾苦，他始终保持劳动人民之本色，一直受到全党、全军和全国各族人民的无限尊敬、爱戴和怀念。
王 震(51.04-55.03)
王震同志是中国共产党的优秀党员，伟大的无产阶级革命家、政治家、军事家，坚定的马克思主义者，党和国家的卓越领导人。他在六十多年的革命生涯中，为中国人民的解放和新中国的建立，为社会主义建设和改革开放事业，做出了重大贡献，深受全党全国各族人民的尊敬和爱戴。
王恩茂(55.03-68.08)
王恩茂(1913年5月-2001年4月)，江西永新人，中国共产党的优秀党员，久经考验的忠诚的共产主义战士，无产阶级革命家，党和军队卓越的政治工作领导者，中国人民解放军高级将领。1955年被授予中将军衔，曾获二级八一勋章、一级独立自由勋章和一级解放勋章。1988年7月被授予一级红星功勋荣誉章。
龙书金(68.08-72.05)
龙书金(1910—2003)湖南省茶陵县人。一九三0年参加中国工农红军，同年加入中国共产主义青年团，一九三二年转入中国共产党。中华人民共和国成立后，任广东省军区司令员兼广州市警备区司令员，湖南省军区司令员，新疆军区司令员。一九五五年被授予少将军衔。是中国共产党第九届中央委员。
曹思明(代，72.05-73.06)
曹思明(1917.12.8~2003.1.3)是中国人民解放军高级将领。汉族，1917年12月8日生，河南商城观庙乡姚榜村近湾组人，1930年任本村儿童团团长，1931年2月被批准加入中国共产主义青年团。1931年7月参加革命工作，1936年5月转为中国共产党党员，少将军衔。曹思明同志曾当选为第七届全国人大代表、第七届全国人大常务委员会委员、内务司法委员会委员;中共第十次、十一次全国代表大会代表，第十一届中央候补委员，1985年被增选为中央纪律检查委员会委员。
杨 勇(73.06-77.07)
杨勇(1913年10月28日-1983年1月6日)原名杨世峻，中国共产党的优秀党员，久经考验的忠诚的共产主义战士，无产阶级革命家、军事家。党和军队的优秀领导人。中国人民解放军开国上将，湖南浏阳县人。是中共闻名的“三杨”之一(另二人是杨成武、杨得志)。1983年1月6日在北京病逝，终年70岁。
刘 震(77.07-79.01)
刘震(1915年3月3日—1992年8月20日)，男，原名刘幼安。湖北省孝感孝昌县人。中国人民解放军高级将领，中国人民解放军空军的奠基人之一。原中共中央顾问委员会委员，原中央军委委员，军事科学院原副院长。1955年被授予上将军衔，曾荣获一级八一勋章、一级独立自由勋章、一级解放勋章、一级红星功勋荣誉章。
吴克华(79.01-80.01)
吴克华(1913—1987)，江西省弋阳县人。中国共产党优秀党员、久经考验的忠诚共产主义战士、无产阶级革命家、中国人民解放军优秀的军事指挥员、中国人民解放军高级将领。解放后，任第15兵团副司令员、华南军区参谋长。1952年7月任海南军区司令员兼第43军军长。1954年7月入南京军事学院学习。1955年9月被授予中将军衔。曾获一级八一勋章、一级独立自由勋章、一级解放勋章。1957年毕业后，任济南军区第一副司令员、人民解放军炮兵司令员、铁道兵司令员，成都军区、新疆军区司令员，1980年至1982年任广州军区司令员。是第三届国防委员会委员，第三、第五届全国人大代表，中共第十一届中央候补委员。1982年被选为中共中央顾问委员会委员。1955年获二级八一勋章、一级独立自由勋章、一级解放勋章。1987年2月13日在广州逝世。
肖全夫(80.01-85.07)
肖全夫，新中国开国少将。1930年参加红军，1933年加入中国共产党。1955年9月，肖全夫被授予少将军衔，荣获二级八一勋章、二级独立自由勋章和一级解放勋章。 是第四届全国人大代表，中国共产党第十一次代表大会代表，1982年他当选12届中央委员。1985年被增选为中顾委委员、1987年再次当选为中顾委委员。1997年、2002年被选为十五大、十六大特邀代表。2005年2月4日逝世。
刘海清(85.07-87.04)
刘海清(1921-2007.8.18)四川通江人;1933年参加中国工农红军;同年加入中国共产主义青年团;土地革命战争时期，他历任宣传员、通讯员、警卫员等职，1935年参加长征;1936年转入中国共产党;抗日战争时期，他历任学员、副排长、排长、八路军一一五师连长、副科长、副营长、营长等职，参加了平型关、新村、郯城、莒县、相州、诸城等战役战斗。与其同名还有航海模型运动员、中国人民大学外国语学院讲师、河南书法家等。
高焕昌(87.04-90.06)
高焕昌(1924.09～2012.10.30)，男，河北省深县人，中共党员，中国人民解放军高级将领、杰出军事指挥员，新疆军区原司令员，第十三届中共中央委员，第六届全国人大代表，第八届全国政协委员。1939年8月参加深县抗日武装游击队，1940年5月加入八路军，1942年2月加入中国共产党。1955年荣获二级独立自由勋章和二级解放勋章。1988年被授予中将军衔，荣获独立功勋荣誉章。2012年10月30日9时18分，高焕昌同志因病在乌鲁木齐逝世，享年89岁。
王 克(90.06-92.10)
王克，男，汉族，1931年8月出生，安徽萧县人，1947年加入中国共产党，1944年8月参加工作，大学学历，中央党校领导干部函授班经济管理专业毕业。曾任中国共产党中央委员会委员、中国共产党中央军事委员会委员、中华人民共和国中央军事委员会委员、中国人民解放军总后勤部部长，上将军衔。
傅秉耀(92.10-97.03)
傅秉耀：1940年11月生，黑龙江巴彦人。1959年2月参加中国人民解放军。曾任陆军第39军116师347团团长，陆军第39军副参谋长。1985年8月任陆军第39集团军军长，1990年6月任新疆军区副司令员，1992年10月任兰州军区副司令员兼新疆军区司令员，1997年3月至2003年12月任成都军区副司令员。七、八届全国人大代表，十届全国政协委员。1988年9月被授予少将军衔，1994年7月晋升为中将军衔。
李良辉(97.03-00.10)
李良辉，中国解放军中将。1940年5月生，河北深州人。2000年10月-2001年1月免职。2001年1月-2003年任济南军区副司令员、党委常委。第10届全国政协常委。
邱衍汉(00.10-07.12)
邱衍汉，男，1965年12月加入中国共产党，1960年7月参加中国人民解放军，大专学历。现任第十一届全国政协常务委员、人口资源环境委员会专职委员。
朱锦林(07.12—— )
朱锦林，男，1950年03月出生，浙江杭州人。首都师范大学马克思主义哲学专业研究生毕业。1969年12月参加中国人民解放军。现任新疆维吾尔自治区党委常委，新疆军区党委副书记、司令员。少将军衔。已于2011年7月任兰州军区副司令员。
副司令员
陶峙岳(55.05-68.10)
赛福鼎艾则孜(55.05-72.07)
张希钦(55.05-68.08)
徐国贤(60.09-72.05)
丁盛(64.08-76.07)
幸元林(68.05-80.12)
张竭诚(68.09-81.12)
亓谦斋(68.08-73.11)
罗 荣(69.01-72.05)
陆敬轩(69.01-75.08)
刘发秀(69.10-75.08)
赖发光(70.03-81.04)
李长林(70.05-83.05)
谭友林(76.10-77.11)
郑三生(76.10-80.11)
艾则佐夫哈斯木(76.10-85.06)
刘海清(76.10-85.06)
王扶之(80.05-85.06)
马 森(82.10-85.06)
王 克(85.06-86.10)
李正忠(85.06-90.07)
张德福(85.06-90.07)
段长金(90.06-92.05)
傅秉耀(90.06-92.10)
段喜康(91.10-94.04)
库尔班艾尔西丁(92.10-05.01)
阎崇厚(93.12-00.08)
方登华(94.07-00.03)
张同进(98.12-03.06)
赵文泷(00.03-02.12)
陈时宝(00.08-02.10)
李新光(03.06—— )
赵士忠(96.05-98.12)
马殿魁(97.02-00.10)
李 星(03.06-05.07)
刘 勇(03.12—— )
张世铭(05.07—— )
吐尔逊卡德尔(03.12—— )
贾列肯别克西(07.07—— )
政治委员
彭德怀(49.11-51.04)
王 震(51.04-55.03)
王恩茂(代，52.08-55.03)
肖思明(65.06-71.07)
曹思明(二，71.02-72.05)
赛福鼎艾则孜(代，72.05-73.06)
郭林祥(二，75.08-80.01)
司马义艾买提(75.08-82.01)
汪 锋(一，78.01-82.01)
谭友林(80.03-83.05)
谷景生(81.02-82.10)
王恩茂(一，82.01-85.06)
谭善和(83.10-85.06)
唐广才(85.07-90.06)
潘兆民(90.06-96.01)
周永顺(96.01-00.10)
喻林祥(00.10-04.12)
田修思(04.12—— )